1、尿液標本：先清潔外陰，并用0.1%新潔爾滅消毒尿道口及外陰，然后用無菌棉球擦干，病人自行排尿，用無菌小瓶留取中段尿，立即蓋好瓶蓋送檢。注意尿中勿加防腐劑。

2、痰液標本：晨起用清水或3%的雙氧水漱口3次，然后用力咯出氣管深處痰液，盛于清潔無菌容器內立即蓋蓋送檢。注意標本力求新鮮，以免細菌自溶，標本內切勿混入唾液及鼻咽分泌物。

3、血培養標本：一般應在發熱初期或發熱高峰時采集，并且要在用抗生素之前，只有這樣才能得到較高的陽性率。大多數的菌血癥是間歇性的，往往需要以反復多次血培養來證實。

4、糞便標本：病人在清晨便盆內排便，用無菌棉簽取大便的膿血或粘液部分少許，放入無菌試管中送檢，試管中不可混入尿液等異物及其他化學藥品。特殊標本由醫務人員用無菌棉簽蘸等滲鹽水，由肛門插入6～7cm，輕輕旋動取出大便少許，放入無菌培養管中，加蓋滅菌封口送檢。